روش جدید دستکاری ژنتیک ابداع شد - وبلاگ سیما

به گزارش وبلاگ سیما به نقل از انگجت، محققان انستیتو وایس دانشگاه هاروارد یک ابزار جدید مهندسی ژنتیک ابداع نموده اند که به محققان یاری می نماید همزمان میلیون ها آزمایش ژنتیکی انجام دهند.

این روش Retron Library Recombination یا(RLR) نام گرفته که با استفاده از قسمت های دی ان ای باکتریایی به نام رترون می تواند بخش هایی از یک شاخه دی ان ای را بسازد.

در حوزه مهندسی ژنتیک، ابزار CRISPR-CAS9 مشهور ترین روش به حساب می آید و طی سال های گذشته به نوآوری های مهمی منجر شده است.

این ابزار به محققان یاری می نماید تا به راحتی توالی دی ان ای را دگرگون نمایند، اما محدودیت هایی نیز دارد. به عنوان مثال به سختی می توان آن را در مقیاس انبوه به کار گرفت و همین امر در مطالعات چالش برانگیز است. از سوی دیگر ممکن است این روش برای سلول ها سمی باشد، زیرا آنزیم Cas9 (قیچی مولکولی که وظیفه بریدن شاخه های دی ان ای را دارد) بیشتر اوقات مقاطعی غیر از قسمت هدف را نیز می برد.

ابزار CRISPR به طور فیزیکی دی ان ای را قطع می نماید تا یک توالی جهش یافته را به ژنوم آن متصل کند. اما رترون ها می توانند شاخه دی ان ای جهش یافته را به سلول تکثیر شده متصل نمایند. از سوی دیگر توالی رترون ها به عنوان بارکد یا برچسب نام عمل می نماید و به محققان اجازه می دهد هر توالی را به طور جداگانه ردیابی نمایند. این بدان معنا است که می توان از رترون ها برای مهندسی ژنتیک بدون آسیب به دی ان ای اولیه استفاده کرد و همچنین می توان آنها را برای انجام چند آزمایش به کار برد.

محققان دانشگاه هاروارد RLR را روی باکتری ای کولای آزمایش کردند و ثابت کردند استفاده از این روش در آزمایش های ژنتیکی وسیع کارآمد است. آنها طی آزمایشات خود، توانستند با معین توالی بارکد رترون ها، به جای معین توالی جهش های جداگانه، جهش های مقاومت آنتی بیوتیکی در باکتری ای کولای را بیابند و در نتیجه فرایند سریع تر انجام شد.

مکس شوبرت یکی از مؤلفان این تحقیق می گوید: RLR ما را قادر به انجام کارهایی می نماید که با CRISPR ممکن نیست. ما به طور تصادفی ژنوم باکتری را جدا و این بخش های ژنتیکی را به شاخه های جداگانه دی ان ای تبدیل کردیم. سپس از آنها برای آنالیز میلیون توالی همزمان استفاده کردیم. RLR یک ابزار مهندسی ژنتیک انعطاف پذیرتر است که می توان آن را برای آزمایش های متعدد استفاده کرد. همچنین ویژگی سمی بودن ابزار که در آزمایش های CRISPR مشاهد می گردد نیز حذف می گردد و در نتیجه توانایی محققان برای آنالیز جهش ها در سطح ژنوم بالا می رود.

البته هنوز باید آنالیز و تحقیقات بیشتری درباره روشRLR گردد تا بتوان آن را به طور گسترده به کار برد. محققان معتقدند این امر به ایجاد نوآوری های جدید و غیرمنتظره ای منجر می گردد.